Protein–RNA interactions for Protein: Q01201

RELB, Transcription factor RelB, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELBQ01201 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RELBQ01201 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RELBQ01201 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RELBQ01201 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RELBQ01201 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RELBQ01201 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RELBQ01201 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RELBQ01201 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RELBQ01201 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RELBQ01201 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RELBQ01201 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RELBQ01201 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RELBQ01201 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RELBQ01201 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RELBQ01201 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RELBQ01201 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RELBQ01201 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RELBQ01201 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RELBQ01201 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RELBQ01201 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RELBQ01201 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RELBQ01201 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RELBQ01201 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RELBQ01201 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RELBQ01201 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RELBQ01201 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RELBQ01201 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RELBQ01201 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RELBQ01201 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RELBQ01201 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RELBQ01201 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RELBQ01201 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RELBQ01201 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RELBQ01201 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RELBQ01201 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RELBQ01201 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RELBQ01201 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RELBQ01201 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RELBQ01201 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RELBQ01201 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RELBQ01201 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RELBQ01201 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RELBQ01201 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RELBQ01201 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RELBQ01201 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RELBQ01201 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RELBQ01201 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RELBQ01201 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RELBQ01201 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RELBQ01201 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RELBQ01201 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RELBQ01201 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RELBQ01201 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RELBQ01201 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RELBQ01201 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RELBQ01201 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RELBQ01201 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RELBQ01201 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RELBQ01201 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RELBQ01201 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RELBQ01201 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RELBQ01201 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RELBQ01201 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RELBQ01201 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RELBQ01201 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RELBQ01201 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RELBQ01201 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RELBQ01201 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RELBQ01201 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RELBQ01201 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RELBQ01201 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RELBQ01201 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RELBQ01201 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RELBQ01201 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RELBQ01201 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RELBQ01201 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RELBQ01201 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RELBQ01201 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RELBQ01201 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RELBQ01201 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RELBQ01201 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RELBQ01201 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RELBQ01201 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RELBQ01201 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RELBQ01201 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RELBQ01201 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RELBQ01201 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RELBQ01201 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RELBQ01201 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RELBQ01201 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RELBQ01201 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RELBQ01201 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RELBQ01201 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RELBQ01201 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RELBQ01201 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RELBQ01201 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RELBQ01201 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RELBQ01201 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RELBQ01201 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RELBQ01201 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms