Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKB2Q00653 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKB2Q00653 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NFKB2Q00653 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms