Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDC42EP1Q00587 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDC42EP1Q00587 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CDC42EP1Q00587 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC42EP1Q00587 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC42EP1Q00587 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC42EP1Q00587 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC42EP1Q00587 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC42EP1Q00587 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC42EP1Q00587 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC42EP1Q00587 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC42EP1Q00587 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC42EP1Q00587 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC42EP1Q00587 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC42EP1Q00587 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC42EP1Q00587 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC42EP1Q00587 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC42EP1Q00587 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC42EP1Q00587 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC42EP1Q00587 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC42EP1Q00587 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC42EP1Q00587 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC42EP1Q00587 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC42EP1Q00587 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC42EP1Q00587 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC42EP1Q00587 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC42EP1Q00587 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC42EP1Q00587 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC42EP1Q00587 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC42EP1Q00587 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC42EP1Q00587 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC42EP1Q00587 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC42EP1Q00587 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC42EP1Q00587 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC42EP1Q00587 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC42EP1Q00587 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC42EP1Q00587 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC42EP1Q00587 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms