Protein–RNA interactions for Protein: P98196

ATP11A, Probable phospholipid-transporting ATPase IH, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11AP98196 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP11AP98196 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP11AP98196 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP11AP98196 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP11AP98196 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP11AP98196 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP11AP98196 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP11AP98196 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP11AP98196 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP11AP98196 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP11AP98196 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP11AP98196 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP11AP98196 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP11AP98196 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP11AP98196 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP11AP98196 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP11AP98196 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP11AP98196 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP11AP98196 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP11AP98196 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP11AP98196 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP11AP98196 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP11AP98196 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP11AP98196 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP11AP98196 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP11AP98196 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP11AP98196 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP11AP98196 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP11AP98196 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP11AP98196 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP11AP98196 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP11AP98196 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP11AP98196 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP11AP98196 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP11AP98196 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP11AP98196 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP11AP98196 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP11AP98196 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP11AP98196 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP11AP98196 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP11AP98196 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP11AP98196 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP11AP98196 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP11AP98196 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP11AP98196 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms