Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD1P98174 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD1P98174 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD1P98174 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD1P98174 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FGD1P98174 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGD1P98174 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGD1P98174 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGD1P98174 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGD1P98174 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGD1P98174 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FGD1P98174 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGD1P98174 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGD1P98174 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGD1P98174 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FGD1P98174 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGD1P98174 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGD1P98174 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGD1P98174 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGD1P98174 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FGD1P98174 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FGD1P98174 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FGD1P98174 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FGD1P98174 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FGD1P98174 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FGD1P98174 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FGD1P98174 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FGD1P98174 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
FGD1P98174 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FGD1P98174 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FGD1P98174 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FGD1P98174 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FGD1P98174 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FGD1P98174 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
FGD1P98174 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
FGD1P98174 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
FGD1P98174 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
FGD1P98174 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FGD1P98174 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FGD1P98174 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FGD1P98174 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FGD1P98174 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FGD1P98174 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FGD1P98174 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FGD1P98174 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FGD1P98174 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FGD1P98174 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FGD1P98174 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FGD1P98174 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FGD1P98174 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FGD1P98174 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FGD1P98174 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FGD1P98174 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FGD1P98174 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FGD1P98174 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FGD1P98174 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FGD1P98174 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FGD1P98174 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FGD1P98174 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FGD1P98174 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FGD1P98174 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGD1P98174 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGD1P98174 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGD1P98174 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGD1P98174 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGD1P98174 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FGD1P98174 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FGD1P98174 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FGD1P98174 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FGD1P98174 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FGD1P98174 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FGD1P98174 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FGD1P98174 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FGD1P98174 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FGD1P98174 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FGD1P98174 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FGD1P98174 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FGD1P98174 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FGD1P98174 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FGD1P98174 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FGD1P98174 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FGD1P98174 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FGD1P98174 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FGD1P98174 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FGD1P98174 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FGD1P98174 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
FGD1P98174 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FGD1P98174 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FGD1P98174 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
FGD1P98174 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FGD1P98174 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FGD1P98174 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FGD1P98174 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FGD1P98174 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FGD1P98174 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FGD1P98174 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FGD1P98174 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FGD1P98174 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FGD1P98174 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
FGD1P98174 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms