Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKP1P63208 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKP1P63208 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKP1P63208 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKP1P63208 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKP1P63208 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SKP1P63208 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKP1P63208 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKP1P63208 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKP1P63208 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKP1P63208 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKP1P63208 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKP1P63208 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKP1P63208 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKP1P63208 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SKP1P63208 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKP1P63208 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKP1P63208 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKP1P63208 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SKP1P63208 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKP1P63208 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKP1P63208 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKP1P63208 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SKP1P63208 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKP1P63208 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKP1P63208 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKP1P63208 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKP1P63208 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKP1P63208 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKP1P63208 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKP1P63208 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKP1P63208 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKP1P63208 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKP1P63208 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKP1P63208 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SKP1P63208 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKP1P63208 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKP1P63208 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKP1P63208 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKP1P63208 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKP1P63208 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SKP1P63208 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SKP1P63208 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SKP1P63208 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKP1P63208 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SKP1P63208 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKP1P63208 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKP1P63208 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKP1P63208 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKP1P63208 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKP1P63208 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKP1P63208 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SKP1P63208 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SKP1P63208 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SKP1P63208 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKP1P63208 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKP1P63208 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKP1P63208 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKP1P63208 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKP1P63208 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKP1P63208 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKP1P63208 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKP1P63208 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKP1P63208 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SKP1P63208 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKP1P63208 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKP1P63208 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKP1P63208 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKP1P63208 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKP1P63208 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKP1P63208 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKP1P63208 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SKP1P63208 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKP1P63208 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SKP1P63208 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKP1P63208 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKP1P63208 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKP1P63208 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SKP1P63208 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKP1P63208 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKP1P63208 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKP1P63208 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKP1P63208 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKP1P63208 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKP1P63208 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKP1P63208 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKP1P63208 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKP1P63208 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKP1P63208 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKP1P63208 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKP1P63208 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKP1P63208 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKP1P63208 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SKP1P63208 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKP1P63208 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKP1P63208 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKP1P63208 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKP1P63208 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKP1P63208 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SKP1P63208 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1451.7 ms