Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOBP62745 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOBP62745 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOBP62745 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOBP62745 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOBP62745 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOBP62745 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOBP62745 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOBP62745 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOBP62745 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOBP62745 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOBP62745 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOBP62745 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOBP62745 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOBP62745 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOBP62745 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOBP62745 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOBP62745 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOBP62745 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOBP62745 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOBP62745 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOBP62745 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOBP62745 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOBP62745 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOBP62745 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOBP62745 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOBP62745 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOBP62745 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOBP62745 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOBP62745 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOBP62745 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOBP62745 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOBP62745 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOBP62745 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOBP62745 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOBP62745 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOBP62745 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHOBP62745 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHOBP62745 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHOBP62745 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHOBP62745 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHOBP62745 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RHOBP62745 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHOBP62745 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHOBP62745 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHOBP62745 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHOBP62745 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOBP62745 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOBP62745 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOBP62745 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOBP62745 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOBP62745 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOBP62745 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHOBP62745 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOBP62745 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOBP62745 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOBP62745 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOBP62745 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOBP62745 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOBP62745 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHOBP62745 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHOBP62745 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHOBP62745 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHOBP62745 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHOBP62745 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOBP62745 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOBP62745 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOBP62745 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOBP62745 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOBP62745 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOBP62745 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOBP62745 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOBP62745 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOBP62745 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOBP62745 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOBP62745 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOBP62745 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOBP62745 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOBP62745 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOBP62745 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOBP62745 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOBP62745 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOBP62745 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOBP62745 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOBP62745 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOBP62745 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOBP62745 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOBP62745 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOBP62745 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOBP62745 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOBP62745 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOBP62745 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOBP62745 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOBP62745 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOBP62745 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOBP62745 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOBP62745 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOBP62745 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOBP62745 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOBP62745 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms