Protein–RNA interactions for Protein: P62140

PPP1CB, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CBP62140 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PPP1CBP62140 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP1CBP62140 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPP1CBP62140 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPP1CBP62140 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPP1CBP62140 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP1CBP62140 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP1CBP62140 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP1CBP62140 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP1CBP62140 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP1CBP62140 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP1CBP62140 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP1CBP62140 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP1CBP62140 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPP1CBP62140 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPP1CBP62140 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms