Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPTEP56180 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPTEP56180 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPTEP56180 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TPTEP56180 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPTEP56180 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPTEP56180 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPTEP56180 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TPTEP56180 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPTEP56180 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPTEP56180 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TPTEP56180 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPTEP56180 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TPTEP56180 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPTEP56180 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPTEP56180 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPTEP56180 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPTEP56180 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPTEP56180 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPTEP56180 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPTEP56180 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPTEP56180 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPTEP56180 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPTEP56180 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TPTEP56180 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TPTEP56180 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TPTEP56180 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TPTEP56180 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TPTEP56180 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TPTEP56180 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TPTEP56180 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TPTEP56180 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TPTEP56180 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPTEP56180 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPTEP56180 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPTEP56180 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPTEP56180 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPTEP56180 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPTEP56180 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPTEP56180 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPTEP56180 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPTEP56180 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TPTEP56180 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPTEP56180 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TPTEP56180 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPTEP56180 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPTEP56180 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPTEP56180 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPTEP56180 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPTEP56180 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TPTEP56180 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPTEP56180 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPTEP56180 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPTEP56180 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPTEP56180 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPTEP56180 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPTEP56180 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPTEP56180 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPTEP56180 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPTEP56180 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TPTEP56180 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPTEP56180 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPTEP56180 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPTEP56180 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPTEP56180 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPTEP56180 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TPTEP56180 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPTEP56180 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPTEP56180 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TPTEP56180 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPTEP56180 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TPTEP56180 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TPTEP56180 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TPTEP56180 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TPTEP56180 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TPTEP56180 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TPTEP56180 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TPTEP56180 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TPTEP56180 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TPTEP56180 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TPTEP56180 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TPTEP56180 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TPTEP56180 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPTEP56180 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPTEP56180 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPTEP56180 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPTEP56180 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPTEP56180 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPTEP56180 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPTEP56180 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TPTEP56180 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPTEP56180 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPTEP56180 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPTEP56180 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPTEP56180 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPTEP56180 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPTEP56180 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPTEP56180 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPTEP56180 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPTEP56180 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms