Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SUMO3P55854 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUMO3P55854 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUMO3P55854 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUMO3P55854 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUMO3P55854 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SUMO3P55854 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUMO3P55854 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SUMO3P55854 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUMO3P55854 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUMO3P55854 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUMO3P55854 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SUMO3P55854 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUMO3P55854 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUMO3P55854 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUMO3P55854 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUMO3P55854 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUMO3P55854 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SUMO3P55854 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SUMO3P55854 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SUMO3P55854 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SUMO3P55854 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SUMO3P55854 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SUMO3P55854 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SUMO3P55854 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SUMO3P55854 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SUMO3P55854 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SUMO3P55854 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SUMO3P55854 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SUMO3P55854 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SUMO3P55854 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121 ms