Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EPHB1P54762 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPHB1P54762 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPHB1P54762 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPHB1P54762 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPHB1P54762 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPHB1P54762 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPHB1P54762 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPHB1P54762 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EPHB1P54762 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB1P54762 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB1P54762 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB1P54762 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB1P54762 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB1P54762 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB1P54762 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB1P54762 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB1P54762 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHB1P54762 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHB1P54762 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHB1P54762 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHB1P54762 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHB1P54762 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHB1P54762 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHB1P54762 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHB1P54762 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHB1P54762 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHB1P54762 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHB1P54762 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EPHB1P54762 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EPHB1P54762 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EPHB1P54762 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EPHB1P54762 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EPHB1P54762 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms