Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP1B3P54709 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP1B3P54709 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP1B3P54709 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms