Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATXN1P54253 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATXN1P54253 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATXN1P54253 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms