Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGA8P53708 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA8P53708 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA8P53708 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms