Protein–RNA interactions for Protein: P52738

ZNF140, Zinc finger protein 140, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF140P52738 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF140P52738 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF140P52738 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF140P52738 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms