Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2A1P52655 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF2A1P52655 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms