Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
UBE2E1P51965 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE2E1P51965 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE2E1P51965 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE2E1P51965 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE2E1P51965 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE2E1P51965 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE2E1P51965 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE2E1P51965 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UBE2E1P51965 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2E1P51965 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2E1P51965 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2E1P51965 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2E1P51965 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2E1P51965 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2E1P51965 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2E1P51965 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2E1P51965 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2E1P51965 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2E1P51965 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2E1P51965 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2E1P51965 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2E1P51965 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2E1P51965 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE2E1P51965 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2E1P51965 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2E1P51965 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2E1P51965 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2E1P51965 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2E1P51965 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2E1P51965 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2E1P51965 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2E1P51965 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE2E1P51965 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms