Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NEK4P51957 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEK4P51957 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEK4P51957 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEK4P51957 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEK4P51957 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEK4P51957 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEK4P51957 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEK4P51957 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEK4P51957 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEK4P51957 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEK4P51957 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEK4P51957 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEK4P51957 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEK4P51957 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NEK4P51957 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NEK4P51957 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEK4P51957 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEK4P51957 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEK4P51957 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEK4P51957 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEK4P51957 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEK4P51957 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEK4P51957 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEK4P51957 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEK4P51957 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEK4P51957 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEK4P51957 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEK4P51957 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEK4P51957 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEK4P51957 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEK4P51957 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEK4P51957 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEK4P51957 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEK4P51957 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEK4P51957 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEK4P51957 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEK4P51957 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEK4P51957 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEK4P51957 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEK4P51957 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEK4P51957 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEK4P51957 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEK4P51957 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEK4P51957 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEK4P51957 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEK4P51957 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEK4P51957 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEK4P51957 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEK4P51957 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEK4P51957 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEK4P51957 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEK4P51957 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEK4P51957 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEK4P51957 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEK4P51957 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEK4P51957 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEK4P51957 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEK4P51957 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEK4P51957 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEK4P51957 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEK4P51957 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEK4P51957 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEK4P51957 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEK4P51957 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEK4P51957 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEK4P51957 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NEK4P51957 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NEK4P51957 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEK4P51957 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEK4P51957 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEK4P51957 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEK4P51957 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEK4P51957 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEK4P51957 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEK4P51957 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEK4P51957 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEK4P51957 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEK4P51957 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEK4P51957 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEK4P51957 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NEK4P51957 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEK4P51957 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEK4P51957 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEK4P51957 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEK4P51957 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEK4P51957 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEK4P51957 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEK4P51957 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEK4P51957 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEK4P51957 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEK4P51957 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEK4P51957 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEK4P51957 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEK4P51957 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEK4P51957 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEK4P51957 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEK4P51957 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEK4P51957 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEK4P51957 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms