Protein–RNA interactions for Protein: P51797

CLCN6, Chloride transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN6P51797 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLCN6P51797 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLCN6P51797 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLCN6P51797 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms