Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
SMARCA2P51531 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
SMARCA2P51531 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
SMARCA2P51531 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
SMARCA2P51531 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
SMARCA2P51531 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
SMARCA2P51531 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
SMARCA2P51531 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
SMARCA2P51531 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
SMARCA2P51531 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
SMARCA2P51531 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
SMARCA2P51531 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC42.3■■■■■ 4.36
SMARCA2P51531 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
SMARCA2P51531 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
SMARCA2P51531 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
SMARCA2P51531 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
SMARCA2P51531 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC42.28■■■■■ 4.36
SMARCA2P51531 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.28■■■■■ 4.36
SMARCA2P51531 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC42.27■■■■■ 4.36
SMARCA2P51531 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
SMARCA2P51531 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
SMARCA2P51531 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
SMARCA2P51531 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
SMARCA2P51531 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
SMARCA2P51531 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC42.26■■■■■ 4.36
SMARCA2P51531 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC42.26■■■■■ 4.35
SMARCA2P51531 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.35
SMARCA2P51531 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
SMARCA2P51531 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC42.25■■■■■ 4.35
SMARCA2P51531 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
SMARCA2P51531 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
SMARCA2P51531 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
SMARCA2P51531 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
SMARCA2P51531 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
SMARCA2P51531 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
SMARCA2P51531 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
SMARCA2P51531 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
SMARCA2P51531 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
SMARCA2P51531 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
SMARCA2P51531 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC42.22■■■■■ 4.35
SMARCA2P51531 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
SMARCA2P51531 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
SMARCA2P51531 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
SMARCA2P51531 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
SMARCA2P51531 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
SMARCA2P51531 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
SMARCA2P51531 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
SMARCA2P51531 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
SMARCA2P51531 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
SMARCA2P51531 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
SMARCA2P51531 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.35
SMARCA2P51531 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
SMARCA2P51531 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC42.19■■■■■ 4.34
SMARCA2P51531 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
SMARCA2P51531 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
SMARCA2P51531 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC42.18■■■■■ 4.34
SMARCA2P51531 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.18■■■■■ 4.34
SMARCA2P51531 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
SMARCA2P51531 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC42.16■■■■■ 4.34
SMARCA2P51531 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
SMARCA2P51531 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
SMARCA2P51531 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
SMARCA2P51531 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
SMARCA2P51531 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
SMARCA2P51531 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
SMARCA2P51531 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
SMARCA2P51531 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC42.14■■■■■ 4.34
SMARCA2P51531 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
SMARCA2P51531 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
SMARCA2P51531 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
SMARCA2P51531 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
SMARCA2P51531 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
SMARCA2P51531 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC42.12■■■■■ 4.33
SMARCA2P51531 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
SMARCA2P51531 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
SMARCA2P51531 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
SMARCA2P51531 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
SMARCA2P51531 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
SMARCA2P51531 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC42.11■■■■■ 4.33
SMARCA2P51531 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
SMARCA2P51531 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
SMARCA2P51531 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC42.1■■■■■ 4.33
SMARCA2P51531 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
SMARCA2P51531 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
SMARCA2P51531 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
SMARCA2P51531 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
SMARCA2P51531 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC42.1■■■■■ 4.33
SMARCA2P51531 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
SMARCA2P51531 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC42.09■■■■■ 4.33
SMARCA2P51531 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
SMARCA2P51531 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
SMARCA2P51531 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC42.09■■■■■ 4.33
SMARCA2P51531 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC42.09■■■■■ 4.33
SMARCA2P51531 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC42.09■■■■■ 4.33
SMARCA2P51531 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
SMARCA2P51531 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
SMARCA2P51531 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC42.07■■■■■ 4.33
SMARCA2P51531 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
SMARCA2P51531 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
SMARCA2P51531 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC42.07■■■■■ 4.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.3 ms