Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCNN1GP51170 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCNN1GP51170 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCNN1GP51170 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCNN1GP51170 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCNN1GP51170 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCNN1GP51170 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCNN1GP51170 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCNN1GP51170 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCNN1GP51170 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SCNN1GP51170 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCNN1GP51170 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCNN1GP51170 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCNN1GP51170 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCNN1GP51170 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 358.8 ms