Protein–RNA interactions for Protein: P51164

ATP4B, Potassium-transporting ATPase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4BP51164 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP4BP51164 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP4BP51164 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms