Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB28P51157 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB28P51157 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB28P51157 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB28P51157 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB28P51157 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB28P51157 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB28P51157 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB28P51157 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB28P51157 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB28P51157 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB28P51157 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB28P51157 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB28P51157 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB28P51157 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB28P51157 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB28P51157 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB28P51157 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB28P51157 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB28P51157 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB28P51157 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB28P51157 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB28P51157 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB28P51157 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB28P51157 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB28P51157 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB28P51157 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB28P51157 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB28P51157 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB28P51157 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB28P51157 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB28P51157 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB28P51157 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB28P51157 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB28P51157 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB28P51157 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB28P51157 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB28P51157 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB28P51157 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB28P51157 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB28P51157 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB28P51157 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB28P51157 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB28P51157 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB28P51157 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB28P51157 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB28P51157 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB28P51157 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB28P51157 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB28P51157 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB28P51157 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB28P51157 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB28P51157 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB28P51157 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB28P51157 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB28P51157 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB28P51157 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB28P51157 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB28P51157 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB28P51157 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB28P51157 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB28P51157 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB28P51157 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB28P51157 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB28P51157 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB28P51157 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB28P51157 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB28P51157 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB28P51157 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB28P51157 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB28P51157 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB28P51157 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB28P51157 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB28P51157 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB28P51157 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB28P51157 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB28P51157 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB28P51157 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB28P51157 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB28P51157 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB28P51157 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB28P51157 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB28P51157 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB28P51157 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB28P51157 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB28P51157 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB28P51157 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB28P51157 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB28P51157 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB28P51157 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB28P51157 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB28P51157 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB28P51157 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB28P51157 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB28P51157 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB28P51157 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB28P51157 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB28P51157 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB28P51157 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB28P51157 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms