Protein–RNA interactions for Protein: P50748

KNTC1, Kinetochore-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNTC1P50748 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KNTC1P50748 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNTC1P50748 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms