Protein–RNA interactions for Protein: P49746

THBS3, Thrombospondin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3P49746 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
THBS3P49746 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
THBS3P49746 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
THBS3P49746 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
THBS3P49746 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
THBS3P49746 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
THBS3P49746 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
THBS3P49746 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
THBS3P49746 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
THBS3P49746 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
THBS3P49746 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
THBS3P49746 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
THBS3P49746 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
THBS3P49746 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
THBS3P49746 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
THBS3P49746 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
THBS3P49746 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
THBS3P49746 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
THBS3P49746 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
THBS3P49746 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
THBS3P49746 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
THBS3P49746 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
THBS3P49746 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
THBS3P49746 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
THBS3P49746 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
THBS3P49746 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
THBS3P49746 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
THBS3P49746 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
THBS3P49746 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
THBS3P49746 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
THBS3P49746 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
THBS3P49746 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
THBS3P49746 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
THBS3P49746 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
THBS3P49746 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
THBS3P49746 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
THBS3P49746 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
THBS3P49746 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
THBS3P49746 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
THBS3P49746 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
THBS3P49746 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
THBS3P49746 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
THBS3P49746 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
THBS3P49746 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
THBS3P49746 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
THBS3P49746 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
THBS3P49746 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
THBS3P49746 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
THBS3P49746 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
THBS3P49746 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
THBS3P49746 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
THBS3P49746 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
THBS3P49746 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
THBS3P49746 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
THBS3P49746 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
THBS3P49746 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
THBS3P49746 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
THBS3P49746 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
THBS3P49746 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
THBS3P49746 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
THBS3P49746 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
THBS3P49746 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
THBS3P49746 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
THBS3P49746 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
THBS3P49746 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
THBS3P49746 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
THBS3P49746 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
THBS3P49746 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
THBS3P49746 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
THBS3P49746 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
THBS3P49746 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
THBS3P49746 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
THBS3P49746 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
THBS3P49746 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
THBS3P49746 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
THBS3P49746 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
THBS3P49746 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
THBS3P49746 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
THBS3P49746 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
THBS3P49746 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
THBS3P49746 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
THBS3P49746 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
THBS3P49746 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
THBS3P49746 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
THBS3P49746 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
THBS3P49746 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
THBS3P49746 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
THBS3P49746 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
THBS3P49746 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
THBS3P49746 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
THBS3P49746 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
THBS3P49746 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
THBS3P49746 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
THBS3P49746 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
THBS3P49746 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
THBS3P49746 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
THBS3P49746 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
THBS3P49746 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
THBS3P49746 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
THBS3P49746 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms