Protein–RNA interactions for Protein: P49720

PSMB3, Proteasome subunit beta type-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB3P49720 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMB3P49720 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB3P49720 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB3P49720 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms