Protein–RNA interactions for Protein: P49682

CXCR3, C-X-C chemokine receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR3P49682 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCR3P49682 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCR3P49682 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCR3P49682 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCR3P49682 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCR3P49682 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCR3P49682 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCR3P49682 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCR3P49682 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCR3P49682 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCR3P49682 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCR3P49682 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCR3P49682 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCR3P49682 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCR3P49682 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCR3P49682 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCR3P49682 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCR3P49682 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXCR3P49682 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CXCR3P49682 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXCR3P49682 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXCR3P49682 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXCR3P49682 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCR3P49682 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCR3P49682 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCR3P49682 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCR3P49682 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCR3P49682 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCR3P49682 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCR3P49682 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCR3P49682 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCR3P49682 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCR3P49682 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCR3P49682 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCR3P49682 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCR3P49682 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCR3P49682 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCR3P49682 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCR3P49682 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CXCR3P49682 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CXCR3P49682 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCR3P49682 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms