Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 C17orf99-206ENST00000591995 568 ntAPPRIS ALT2 TSL 414.38□□□□□ -0.118e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ALOX12-AS1-205ENST00000572385 576 ntTSL 414.36□□□□□ -0.118e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 WDTC1-203ENST00000447062 3115 ntTSL 214.34□□□□□ -0.118e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ZNF142-207ENST00000450765 6028 ntTSL 1 (best)14.29□□□□□ -0.128e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.148e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.168e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.168e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 STRN4-212ENST00000596012 560 ntTSL 414.04□□□□□ -0.168e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.168e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.178e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SLC25A21-205ENST00000557611 591 ntTSL 513.92□□□□□ -0.188e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TRIM13-205ENST00000442421 692 ntTSL 513.92□□□□□ -0.188e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TTI2-204ENST00000520636 1588 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.198e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 RN7SL4P-201ENST00000584058 295 ntBASIC13.87□□□□□ -0.198e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ADGRD1-202ENST00000335486 2892 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.198e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SLC25A42-202ENST00000594070 1228 ntTSL 213.79□□□□□ -0.28e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 WDTC1-205ENST00000491239 5149 ntTSL 213.75□□□□□ -0.218e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 LAPTM5-203ENST00000476492 960 ntTSL 213.7□□□□□ -0.228e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.228e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MSH6-213ENST00000614496 4150 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.228e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SDCCAG8-201ENST00000366541 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.238e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.248e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TRIM13-207ENST00000474805 403 ntTSL 513.48□□□□□ -0.258e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 HMG20B-211ENST00000486028 719 ntTSL 213.45□□□□□ -0.268e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 THOC5-207ENST00000428374 729 ntTSL 213.45□□□□□ -0.268e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ZNF124-201ENST00000340684 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.288e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.298e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ZNF124-205ENST00000491848 701 ntTSL 313.25□□□□□ -0.298e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 DYRK4-209ENST00000539701 945 ntTSL 513.23□□□□□ -0.298e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TNPO2-214ENST00000589337 541 ntTSL 413.08□□□□□ -0.328e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 HNRNPUL1-206ENST00000594207 816 ntTSL 513.07□□□□□ -0.328e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SLC25A42-206ENST00000600275 318 ntTSL 313.05□□□□□ -0.328e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ZNF540-210ENST00000592533 3147 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.338e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MSH6-204ENST00000445503 4158 ntTSL 1 (best)12.98□□□□□ -0.338e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 EXOC5-202ENST00000413566 8513 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.338e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 VDAC1-202ENST00000395044 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.348e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SMS-204ENST00000478094 488 ntTSL 412.9□□□□□ -0.348e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 EXOC5-207ENST00000555749 594 ntTSL 212.89□□□□□ -0.358e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 NDUFS2-211ENST00000483804 1062 ntTSL 512.87□□□□□ -0.358e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 NDUFS2-210ENST00000480762 951 ntTSL 512.83□□□□□ -0.368e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ACVR1-207ENST00000434821 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.368e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 DYRK4-207ENST00000539309 989 ntTSL 512.78□□□□□ -0.368e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SMS-202ENST00000404933 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.388e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ZNF142-205ENST00000449707 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.398e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TPCN2-202ENST00000442692 4376 ntTSL 212.53□□□□□ -0.48e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 EIF4G1-228ENST00000456033 694 ntTSL 512.48□□□□□ -0.418e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 DYRK4-205ENST00000537719 454 ntTSL 312.48□□□□□ -0.418e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TTI2-203ENST00000519356 1671 ntTSL 312.41□□□□□ -0.428e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ADGRD1-203ENST00000376682 4135 ntTSL 212.4□□□□□ -0.428e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 EHMT1-215ENST00000492232 710 ntTSL 312.38□□□□□ -0.438e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 NDUFB2-206ENST00000464566 726 ntTSL 312.35□□□□□ -0.438e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 EHMT1-230ENST00000636186 100 ntTSL 512.34□□□□□ -0.438e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 THOC5-204ENST00000397873 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.448e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 AP002495.1-204ENST00000529844 1781 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.448e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ADGRD1-213ENST00000543617 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.458e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ALOX12-AS1-203ENST00000570562 567 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.458e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 CIRBP-236ENST00000592051 573 ntTSL 412.23□□□□□ -0.458e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ZNF142-201ENST00000411696 5926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.458e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 FAM238C-201ENST00000638416 868 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.468e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 AL670729.1-201ENST00000436779 283 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.468e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 EHMT1-245ENST00000637662 89 ntTSL 512.14□□□□□ -0.478e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 PTK2B-203ENST00000397501 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.478e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 PLXNA3-201ENST00000369682 10885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.478e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 GCN1-201ENST00000300648 8675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.488e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 EHMT1-222ENST00000629417 882 ntTSL 312.08□□□□□ -0.488e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SLC25A21-201ENST00000331299 2785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.488e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 EHMT1-231ENST00000636376 100 ntTSL 512.01□□□□□ -0.498e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ZNF142-203ENST00000433921 5800 ntTSL 211.99□□□□□ -0.498e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 EHMT1-241ENST00000637335 86 ntTSL 511.97□□□□□ -0.498e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SETD5-211ENST00000443339 3478 ntTSL 211.89□□□□□ -0.518e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MSH6-201ENST00000234420 7476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.528e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 AL590627.2-202ENST00000636318 138 ntTSL 511.81□□□□□ -0.528e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 AP002495.1-202ENST00000528511 933 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.538e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TTI2-206ENST00000613904 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.548e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ACVR1-210ENST00000539637 564 ntTSL 411.67□□□□□ -0.548e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ALOX12-AS1-209ENST00000575889 439 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.548e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ZNF841-207ENST00000601738 2027 ntTSL 511.67□□□□□ -0.548e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 AL358613.2-201ENST00000624651 567 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.558e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 FAM238C-203ENST00000640121 3620 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.558e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ME1-201ENST00000369705 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.568e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ZNF571-AS1-201ENST00000585578 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.568e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 HIPK1-206ENST00000369559 3424 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.588e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 RFC1-203ENST00000418436 1255 ntTSL 1 (best)11.38□□□□□ -0.598e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TTI2-202ENST00000431156 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.598e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 CCDC144NL-AS1-214ENST00000581958 1188 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.598e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 THOC5-206ENST00000418021 738 ntTSL 311.32□□□□□ -0.68e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 EXOC2-201ENST00000230449 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.68e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ZNF275-202ENST00000370251 6320 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.618e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SMPD4P1-201ENST00000416717 2263 ntBASIC11.17□□□□□ -0.628e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SPTBN2-205ENST00000530665 462 ntTSL 211.16□□□□□ -0.628e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 PSD4-205ENST00000441564 11234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.638e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TTI2-201ENST00000360742 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.638e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 UTP4-202ENST00000352319 1841 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.648e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 PTK2B-210ENST00000517339 3914 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.648e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SH3D21-206ENST00000508854 1134 ntTSL 510.89□□□□□ -0.678e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TGIF2-208ENST00000611732 3344 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.678e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ADGRD1-205ENST00000535015 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.688e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 THOC5-208ENST00000440771 1006 ntTSL 310.79□□□□□ -0.688e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 PLXNA3-207ENST00000493546 793 ntTSL 310.66□□□□□ -0.78e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 EXOC5-211ENST00000621441 10589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.748e-6■■■■■ 52.4
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