Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNTAP49354 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNTAP49354 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNTAP49354 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FNTAP49354 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNTAP49354 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNTAP49354 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNTAP49354 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNTAP49354 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNTAP49354 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FNTAP49354 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNTAP49354 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNTAP49354 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNTAP49354 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNTAP49354 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FNTAP49354 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FNTAP49354 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNTAP49354 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNTAP49354 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNTAP49354 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNTAP49354 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FNTAP49354 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNTAP49354 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNTAP49354 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNTAP49354 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNTAP49354 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNTAP49354 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FNTAP49354 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
FNTAP49354 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FNTAP49354 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FNTAP49354 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FNTAP49354 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FNTAP49354 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FNTAP49354 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNTAP49354 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNTAP49354 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNTAP49354 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNTAP49354 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNTAP49354 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNTAP49354 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNTAP49354 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNTAP49354 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNTAP49354 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNTAP49354 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNTAP49354 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNTAP49354 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNTAP49354 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNTAP49354 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNTAP49354 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FNTAP49354 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNTAP49354 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNTAP49354 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNTAP49354 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FNTAP49354 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNTAP49354 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNTAP49354 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNTAP49354 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNTAP49354 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNTAP49354 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNTAP49354 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNTAP49354 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNTAP49354 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FNTAP49354 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FNTAP49354 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FNTAP49354 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FNTAP49354 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FNTAP49354 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FNTAP49354 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNTAP49354 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FNTAP49354 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNTAP49354 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNTAP49354 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNTAP49354 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FNTAP49354 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FNTAP49354 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FNTAP49354 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FNTAP49354 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FNTAP49354 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FNTAP49354 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNTAP49354 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNTAP49354 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FNTAP49354 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNTAP49354 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNTAP49354 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNTAP49354 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNTAP49354 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FNTAP49354 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FNTAP49354 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNTAP49354 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FNTAP49354 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNTAP49354 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNTAP49354 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNTAP49354 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNTAP49354 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNTAP49354 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FNTAP49354 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNTAP49354 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNTAP49354 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNTAP49354 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FNTAP49354 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms