Protein–RNA interactions for Protein: P49223

SPINT3, Kunitz-type protease inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT3P49223 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPINT3P49223 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPINT3P49223 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SPINT3P49223 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPINT3P49223 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPINT3P49223 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPINT3P49223 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPINT3P49223 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPINT3P49223 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPINT3P49223 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPINT3P49223 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPINT3P49223 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SPINT3P49223 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPINT3P49223 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPINT3P49223 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPINT3P49223 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPINT3P49223 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPINT3P49223 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPINT3P49223 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPINT3P49223 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPINT3P49223 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPINT3P49223 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPINT3P49223 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPINT3P49223 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPINT3P49223 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPINT3P49223 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPINT3P49223 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPINT3P49223 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPINT3P49223 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPINT3P49223 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPINT3P49223 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPINT3P49223 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPINT3P49223 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPINT3P49223 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPINT3P49223 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPINT3P49223 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPINT3P49223 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPINT3P49223 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPINT3P49223 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPINT3P49223 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPINT3P49223 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPINT3P49223 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPINT3P49223 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPINT3P49223 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SPINT3P49223 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPINT3P49223 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPINT3P49223 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPINT3P49223 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPINT3P49223 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPINT3P49223 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms