Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCLMP48507 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCLMP48507 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCLMP48507 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCLMP48507 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCLMP48507 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCLMP48507 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCLMP48507 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCLMP48507 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCLMP48507 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCLMP48507 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCLMP48507 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCLMP48507 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCLMP48507 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCLMP48507 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCLMP48507 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GCLMP48507 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GCLMP48507 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCLMP48507 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GCLMP48507 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCLMP48507 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCLMP48507 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCLMP48507 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCLMP48507 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCLMP48507 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCLMP48507 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCLMP48507 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCLMP48507 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCLMP48507 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCLMP48507 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GCLMP48507 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCLMP48507 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCLMP48507 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCLMP48507 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCLMP48507 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GCLMP48507 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCLMP48507 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCLMP48507 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCLMP48507 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GCLMP48507 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCLMP48507 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCLMP48507 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCLMP48507 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCLMP48507 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCLMP48507 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GCLMP48507 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GCLMP48507 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCLMP48507 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCLMP48507 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GCLMP48507 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCLMP48507 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCLMP48507 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCLMP48507 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GCLMP48507 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCLMP48507 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GCLMP48507 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCLMP48507 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCLMP48507 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCLMP48507 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCLMP48507 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCLMP48507 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GCLMP48507 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCLMP48507 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCLMP48507 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GCLMP48507 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GCLMP48507 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCLMP48507 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCLMP48507 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCLMP48507 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCLMP48507 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCLMP48507 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCLMP48507 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GCLMP48507 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCLMP48507 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GCLMP48507 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCLMP48507 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GCLMP48507 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCLMP48507 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCLMP48507 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCLMP48507 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCLMP48507 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCLMP48507 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GCLMP48507 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GCLMP48507 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCLMP48507 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GCLMP48507 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCLMP48507 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCLMP48507 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCLMP48507 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCLMP48507 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCLMP48507 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCLMP48507 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCLMP48507 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCLMP48507 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GCLMP48507 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCLMP48507 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCLMP48507 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GCLMP48507 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCLMP48507 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GCLMP48507 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms