Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSSP48449 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSSP48449 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSSP48449 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LSSP48449 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSSP48449 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSSP48449 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSSP48449 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSSP48449 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSSP48449 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSSP48449 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSSP48449 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSSP48449 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSSP48449 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSSP48449 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSSP48449 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSSP48449 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSSP48449 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSSP48449 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSSP48449 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSSP48449 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSSP48449 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LSSP48449 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LSSP48449 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSSP48449 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSSP48449 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSSP48449 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LSSP48449 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSSP48449 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSSP48449 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSSP48449 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSSP48449 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSSP48449 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LSSP48449 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSSP48449 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSSP48449 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSSP48449 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSSP48449 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSSP48449 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSSP48449 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSSP48449 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LSSP48449 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSSP48449 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSSP48449 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSSP48449 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSSP48449 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LSSP48449 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LSSP48449 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSSP48449 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSSP48449 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSSP48449 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSSP48449 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSSP48449 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSSP48449 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSSP48449 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSSP48449 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSSP48449 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSSP48449 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSSP48449 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSSP48449 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSSP48449 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSSP48449 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSSP48449 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSSP48449 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSSP48449 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSSP48449 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSSP48449 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSSP48449 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSSP48449 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LSSP48449 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSSP48449 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSSP48449 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSSP48449 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSSP48449 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSSP48449 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSSP48449 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSSP48449 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSSP48449 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSSP48449 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSSP48449 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LSSP48449 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSSP48449 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LSSP48449 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSSP48449 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSSP48449 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSSP48449 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSSP48449 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSSP48449 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSSP48449 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LSSP48449 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LSSP48449 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LSSP48449 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LSSP48449 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSSP48449 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSSP48449 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSSP48449 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSSP48449 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSSP48449 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSSP48449 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSSP48449 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.1 ms