Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TM4SF4P48230 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TM4SF4P48230 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TM4SF4P48230 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TM4SF4P48230 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TM4SF4P48230 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TM4SF4P48230 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TM4SF4P48230 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TM4SF4P48230 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TM4SF4P48230 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TM4SF4P48230 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TM4SF4P48230 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TM4SF4P48230 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TM4SF4P48230 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TM4SF4P48230 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TM4SF4P48230 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TM4SF4P48230 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TM4SF4P48230 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TM4SF4P48230 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TM4SF4P48230 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TM4SF4P48230 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TM4SF4P48230 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TM4SF4P48230 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TM4SF4P48230 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TM4SF4P48230 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TM4SF4P48230 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TM4SF4P48230 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TM4SF4P48230 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TM4SF4P48230 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TM4SF4P48230 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TM4SF4P48230 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TM4SF4P48230 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TM4SF4P48230 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TM4SF4P48230 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TM4SF4P48230 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TM4SF4P48230 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TM4SF4P48230 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TM4SF4P48230 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TM4SF4P48230 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TM4SF4P48230 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TM4SF4P48230 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms