Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPZBP47756 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CAPZBP47756 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CAPZBP47756 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPZBP47756 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms