Protein–RNA interactions for Protein: P46776

RPL27A, 60S ribosomal protein L27a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL27AP46776 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL27AP46776 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL27AP46776 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL27AP46776 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL27AP46776 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPL27AP46776 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPL27AP46776 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPL27AP46776 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL27AP46776 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL27AP46776 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms