Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDKN1BP46527 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDKN1BP46527 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDKN1BP46527 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms