Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP5P45974 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP5P45974 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP5P45974 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP5P45974 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP5P45974 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP5P45974 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP5P45974 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP5P45974 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP5P45974 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP5P45974 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP5P45974 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP5P45974 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP5P45974 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP5P45974 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP5P45974 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP5P45974 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP5P45974 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
USP5P45974 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP5P45974 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP5P45974 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP5P45974 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP5P45974 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP5P45974 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
USP5P45974 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP5P45974 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP5P45974 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP5P45974 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP5P45974 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP5P45974 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP5P45974 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP5P45974 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP5P45974 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP5P45974 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
USP5P45974 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP5P45974 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP5P45974 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP5P45974 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP5P45974 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP5P45974 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP5P45974 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
USP5P45974 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP5P45974 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP5P45974 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP5P45974 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP5P45974 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP5P45974 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP5P45974 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP5P45974 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP5P45974 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP5P45974 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP5P45974 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP5P45974 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP5P45974 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP5P45974 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP5P45974 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP5P45974 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP5P45974 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP5P45974 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP5P45974 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP5P45974 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP5P45974 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP5P45974 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP5P45974 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
USP5P45974 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP5P45974 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP5P45974 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP5P45974 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP5P45974 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP5P45974 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP5P45974 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP5P45974 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP5P45974 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP5P45974 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP5P45974 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
USP5P45974 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
USP5P45974 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP5P45974 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP5P45974 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP5P45974 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP5P45974 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP5P45974 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP5P45974 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
USP5P45974 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
USP5P45974 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
USP5P45974 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
USP5P45974 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP5P45974 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP5P45974 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP5P45974 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP5P45974 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP5P45974 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP5P45974 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP5P45974 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP5P45974 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP5P45974 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP5P45974 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP5P45974 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP5P45974 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP5P45974 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms