Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACADSBP45954 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACADSBP45954 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACADSBP45954 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACADSBP45954 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACADSBP45954 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACADSBP45954 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACADSBP45954 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACADSBP45954 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACADSBP45954 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACADSBP45954 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ACADSBP45954 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ACADSBP45954 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms