Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR4A2P43354 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR4A2P43354 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR4A2P43354 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR4A2P43354 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR4A2P43354 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR4A2P43354 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR4A2P43354 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NR4A2P43354 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR4A2P43354 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR4A2P43354 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR4A2P43354 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NR4A2P43354 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NR4A2P43354 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR4A2P43354 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR4A2P43354 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR4A2P43354 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR4A2P43354 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR4A2P43354 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR4A2P43354 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR4A2P43354 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NR4A2P43354 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR4A2P43354 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR4A2P43354 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR4A2P43354 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR4A2P43354 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR4A2P43354 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR4A2P43354 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NR4A2P43354 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NR4A2P43354 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NR4A2P43354 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NR4A2P43354 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NR4A2P43354 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NR4A2P43354 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NR4A2P43354 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NR4A2P43354 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NR4A2P43354 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 604.4 ms