Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTRLP40313 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTRLP40313 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTRLP40313 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTRLP40313 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTRLP40313 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTRLP40313 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTRLP40313 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTRLP40313 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTRLP40313 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTRLP40313 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTRLP40313 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTRLP40313 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTRLP40313 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTRLP40313 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTRLP40313 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTRLP40313 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTRLP40313 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTRLP40313 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTRLP40313 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTRLP40313 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTRLP40313 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTRLP40313 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTRLP40313 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTRLP40313 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTRLP40313 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTRLP40313 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTRLP40313 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTRLP40313 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTRLP40313 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTRLP40313 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTRLP40313 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTRLP40313 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTRLP40313 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTRLP40313 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTRLP40313 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTRLP40313 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CTRLP40313 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTRLP40313 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTRLP40313 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTRLP40313 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTRLP40313 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTRLP40313 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTRLP40313 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTRLP40313 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTRLP40313 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTRLP40313 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTRLP40313 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTRLP40313 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTRLP40313 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTRLP40313 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTRLP40313 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTRLP40313 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTRLP40313 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTRLP40313 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTRLP40313 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTRLP40313 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTRLP40313 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTRLP40313 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTRLP40313 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTRLP40313 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTRLP40313 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTRLP40313 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTRLP40313 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTRLP40313 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTRLP40313 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTRLP40313 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTRLP40313 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTRLP40313 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTRLP40313 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTRLP40313 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTRLP40313 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CTRLP40313 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTRLP40313 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CTRLP40313 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTRLP40313 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTRLP40313 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTRLP40313 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTRLP40313 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTRLP40313 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTRLP40313 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTRLP40313 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTRLP40313 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTRLP40313 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTRLP40313 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTRLP40313 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTRLP40313 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTRLP40313 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTRLP40313 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTRLP40313 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTRLP40313 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTRLP40313 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTRLP40313 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTRLP40313 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTRLP40313 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTRLP40313 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTRLP40313 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTRLP40313 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CTRLP40313 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CTRLP40313 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms