Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
THPOP40225 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
THPOP40225 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
THPOP40225 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
THPOP40225 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
THPOP40225 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
THPOP40225 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
THPOP40225 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
THPOP40225 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
THPOP40225 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
THPOP40225 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THPOP40225 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
THPOP40225 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THPOP40225 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
THPOP40225 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
THPOP40225 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
THPOP40225 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
THPOP40225 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
THPOP40225 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
THPOP40225 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
THPOP40225 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
THPOP40225 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
THPOP40225 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
THPOP40225 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
THPOP40225 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
THPOP40225 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
THPOP40225 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
THPOP40225 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
THPOP40225 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
THPOP40225 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
THPOP40225 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
THPOP40225 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
THPOP40225 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
THPOP40225 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
THPOP40225 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
THPOP40225 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
THPOP40225 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
THPOP40225 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
THPOP40225 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
THPOP40225 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
THPOP40225 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
THPOP40225 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
THPOP40225 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
THPOP40225 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
THPOP40225 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
THPOP40225 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
THPOP40225 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
THPOP40225 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
THPOP40225 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
THPOP40225 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
THPOP40225 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
THPOP40225 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
THPOP40225 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
THPOP40225 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
THPOP40225 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
THPOP40225 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
THPOP40225 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
THPOP40225 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
THPOP40225 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
THPOP40225 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
THPOP40225 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
THPOP40225 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
THPOP40225 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
THPOP40225 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
THPOP40225 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
THPOP40225 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
THPOP40225 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
THPOP40225 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
THPOP40225 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
THPOP40225 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
THPOP40225 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
THPOP40225 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
THPOP40225 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
THPOP40225 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
THPOP40225 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
THPOP40225 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
THPOP40225 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
THPOP40225 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
THPOP40225 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
THPOP40225 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
THPOP40225 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
THPOP40225 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
THPOP40225 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
THPOP40225 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
THPOP40225 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
THPOP40225 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
THPOP40225 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
THPOP40225 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
THPOP40225 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
THPOP40225 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
THPOP40225 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
THPOP40225 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
THPOP40225 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
THPOP40225 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
THPOP40225 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
THPOP40225 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
THPOP40225 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
THPOP40225 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
THPOP40225 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
THPOP40225 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms