Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIPAP38571 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LIPAP38571 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIPAP38571 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIPAP38571 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIPAP38571 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIPAP38571 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIPAP38571 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIPAP38571 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIPAP38571 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIPAP38571 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIPAP38571 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIPAP38571 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIPAP38571 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LIPAP38571 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIPAP38571 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIPAP38571 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LIPAP38571 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LIPAP38571 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LIPAP38571 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LIPAP38571 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LIPAP38571 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LIPAP38571 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LIPAP38571 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LIPAP38571 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LIPAP38571 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LIPAP38571 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LIPAP38571 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LIPAP38571 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LIPAP38571 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LIPAP38571 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LIPAP38571 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LIPAP38571 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIPAP38571 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIPAP38571 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIPAP38571 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIPAP38571 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIPAP38571 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIPAP38571 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIPAP38571 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LIPAP38571 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIPAP38571 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIPAP38571 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIPAP38571 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIPAP38571 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIPAP38571 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LIPAP38571 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LIPAP38571 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LIPAP38571 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LIPAP38571 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LIPAP38571 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LIPAP38571 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LIPAP38571 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIPAP38571 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIPAP38571 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIPAP38571 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIPAP38571 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LIPAP38571 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIPAP38571 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIPAP38571 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LIPAP38571 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIPAP38571 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIPAP38571 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIPAP38571 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIPAP38571 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIPAP38571 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIPAP38571 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIPAP38571 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIPAP38571 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LIPAP38571 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIPAP38571 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIPAP38571 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIPAP38571 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIPAP38571 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIPAP38571 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIPAP38571 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIPAP38571 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIPAP38571 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIPAP38571 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIPAP38571 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIPAP38571 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIPAP38571 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIPAP38571 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIPAP38571 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIPAP38571 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIPAP38571 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIPAP38571 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIPAP38571 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIPAP38571 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIPAP38571 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIPAP38571 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LIPAP38571 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LIPAP38571 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LIPAP38571 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LIPAP38571 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LIPAP38571 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LIPAP38571 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LIPAP38571 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LIPAP38571 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LIPAP38571 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms