Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYLC1P35663 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYLC1P35663 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYLC1P35663 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYLC1P35663 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYLC1P35663 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYLC1P35663 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYLC1P35663 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYLC1P35663 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYLC1P35663 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CYLC1P35663 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYLC1P35663 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYLC1P35663 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYLC1P35663 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYLC1P35663 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYLC1P35663 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYLC1P35663 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYLC1P35663 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYLC1P35663 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYLC1P35663 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CYLC1P35663 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYLC1P35663 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYLC1P35663 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYLC1P35663 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYLC1P35663 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYLC1P35663 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYLC1P35663 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYLC1P35663 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYLC1P35663 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYLC1P35663 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYLC1P35663 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYLC1P35663 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYLC1P35663 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYLC1P35663 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYLC1P35663 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYLC1P35663 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYLC1P35663 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYLC1P35663 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CYLC1P35663 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms