Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DDIT3P35638 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDIT3P35638 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDIT3P35638 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDIT3P35638 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDIT3P35638 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
DDIT3P35638 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
DDIT3P35638 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDIT3P35638 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DDIT3P35638 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDIT3P35638 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDIT3P35638 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DDIT3P35638 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DDIT3P35638 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDIT3P35638 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDIT3P35638 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDIT3P35638 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDIT3P35638 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDIT3P35638 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DDIT3P35638 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDIT3P35638 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDIT3P35638 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDIT3P35638 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
DDIT3P35638 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DDIT3P35638 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDIT3P35638 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DDIT3P35638 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DDIT3P35638 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDIT3P35638 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDIT3P35638 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDIT3P35638 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDIT3P35638 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDIT3P35638 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDIT3P35638 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DDIT3P35638 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDIT3P35638 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DDIT3P35638 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDIT3P35638 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DDIT3P35638 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDIT3P35638 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DDIT3P35638 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDIT3P35638 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDIT3P35638 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DDIT3P35638 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DDIT3P35638 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDIT3P35638 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDIT3P35638 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
DDIT3P35638 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
DDIT3P35638 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDIT3P35638 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms