Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COPB2P35606 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
COPB2P35606 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COPB2P35606 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
COPB2P35606 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COPB2P35606 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COPB2P35606 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COPB2P35606 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COPB2P35606 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COPB2P35606 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COPB2P35606 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COPB2P35606 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
COPB2P35606 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COPB2P35606 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COPB2P35606 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COPB2P35606 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COPB2P35606 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COPB2P35606 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COPB2P35606 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COPB2P35606 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COPB2P35606 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COPB2P35606 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COPB2P35606 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COPB2P35606 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COPB2P35606 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COPB2P35606 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COPB2P35606 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COPB2P35606 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
COPB2P35606 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
COPB2P35606 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
COPB2P35606 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COPB2P35606 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COPB2P35606 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COPB2P35606 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
COPB2P35606 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COPB2P35606 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COPB2P35606 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COPB2P35606 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COPB2P35606 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COPB2P35606 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
COPB2P35606 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COPB2P35606 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COPB2P35606 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COPB2P35606 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COPB2P35606 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COPB2P35606 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COPB2P35606 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COPB2P35606 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COPB2P35606 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COPB2P35606 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
COPB2P35606 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COPB2P35606 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COPB2P35606 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
COPB2P35606 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COPB2P35606 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COPB2P35606 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
COPB2P35606 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COPB2P35606 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COPB2P35606 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COPB2P35606 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COPB2P35606 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COPB2P35606 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COPB2P35606 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COPB2P35606 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COPB2P35606 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COPB2P35606 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COPB2P35606 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COPB2P35606 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
COPB2P35606 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COPB2P35606 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COPB2P35606 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COPB2P35606 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COPB2P35606 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COPB2P35606 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COPB2P35606 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COPB2P35606 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COPB2P35606 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COPB2P35606 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COPB2P35606 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
COPB2P35606 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COPB2P35606 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COPB2P35606 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COPB2P35606 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COPB2P35606 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COPB2P35606 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COPB2P35606 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COPB2P35606 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COPB2P35606 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COPB2P35606 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COPB2P35606 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COPB2P35606 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COPB2P35606 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COPB2P35606 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COPB2P35606 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COPB2P35606 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COPB2P35606 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COPB2P35606 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
COPB2P35606 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COPB2P35606 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COPB2P35606 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms