Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCKARP32238 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCKARP32238 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCKARP32238 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCKARP32238 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCKARP32238 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCKARP32238 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCKARP32238 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCKARP32238 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCKARP32238 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCKARP32238 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCKARP32238 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCKARP32238 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCKARP32238 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCKARP32238 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCKARP32238 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCKARP32238 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCKARP32238 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCKARP32238 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCKARP32238 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCKARP32238 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCKARP32238 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCKARP32238 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCKARP32238 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCKARP32238 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCKARP32238 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCKARP32238 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCKARP32238 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCKARP32238 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCKARP32238 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCKARP32238 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCKARP32238 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCKARP32238 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCKARP32238 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCKARP32238 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCKARP32238 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCKARP32238 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCKARP32238 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCKARP32238 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCKARP32238 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCKARP32238 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCKARP32238 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCKARP32238 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCKARP32238 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCKARP32238 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCKARP32238 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCKARP32238 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCKARP32238 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCKARP32238 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCKARP32238 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCKARP32238 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCKARP32238 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCKARP32238 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCKARP32238 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCKARP32238 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCKARP32238 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCKARP32238 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCKARP32238 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCKARP32238 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCKARP32238 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCKARP32238 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCKARP32238 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCKARP32238 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCKARP32238 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCKARP32238 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCKARP32238 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCKARP32238 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCKARP32238 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCKARP32238 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCKARP32238 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCKARP32238 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCKARP32238 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCKARP32238 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCKARP32238 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCKARP32238 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCKARP32238 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCKARP32238 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCKARP32238 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCKARP32238 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCKARP32238 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCKARP32238 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCKARP32238 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCKARP32238 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCKARP32238 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCKARP32238 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCKARP32238 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCKARP32238 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCKARP32238 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCKARP32238 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCKARP32238 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCKARP32238 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCKARP32238 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCKARP32238 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCKARP32238 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCKARP32238 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCKARP32238 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCKARP32238 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCKARP32238 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCKARP32238 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCKARP32238 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms