Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA9P31269 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXA9P31269 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA9P31269 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA9P31269 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA9P31269 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA9P31269 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA9P31269 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA9P31269 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA9P31269 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA9P31269 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA9P31269 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA9P31269 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA9P31269 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA9P31269 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA9P31269 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA9P31269 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA9P31269 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA9P31269 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA9P31269 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA9P31269 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA9P31269 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA9P31269 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA9P31269 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA9P31269 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA9P31269 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA9P31269 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms