Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHRNA5P30532 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHRNA5P30532 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHRNA5P30532 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHRNA5P30532 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHRNA5P30532 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CHRNA5P30532 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHRNA5P30532 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHRNA5P30532 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHRNA5P30532 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CHRNA5P30532 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHRNA5P30532 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHRNA5P30532 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHRNA5P30532 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CHRNA5P30532 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHRNA5P30532 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHRNA5P30532 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHRNA5P30532 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHRNA5P30532 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHRNA5P30532 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHRNA5P30532 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHRNA5P30532 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHRNA5P30532 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHRNA5P30532 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHRNA5P30532 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHRNA5P30532 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHRNA5P30532 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHRNA5P30532 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHRNA5P30532 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHRNA5P30532 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHRNA5P30532 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHRNA5P30532 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHRNA5P30532 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHRNA5P30532 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHRNA5P30532 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CHRNA5P30532 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHRNA5P30532 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHRNA5P30532 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHRNA5P30532 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHRNA5P30532 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHRNA5P30532 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHRNA5P30532 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHRNA5P30532 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHRNA5P30532 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHRNA5P30532 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHRNA5P30532 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CHRNA5P30532 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHRNA5P30532 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHRNA5P30532 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CHRNA5P30532 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHRNA5P30532 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHRNA5P30532 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHRNA5P30532 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHRNA5P30532 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHRNA5P30532 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHRNA5P30532 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHRNA5P30532 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CHRNA5P30532 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHRNA5P30532 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHRNA5P30532 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHRNA5P30532 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHRNA5P30532 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHRNA5P30532 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHRNA5P30532 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHRNA5P30532 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHRNA5P30532 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHRNA5P30532 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHRNA5P30532 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHRNA5P30532 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CHRNA5P30532 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHRNA5P30532 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHRNA5P30532 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHRNA5P30532 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHRNA5P30532 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHRNA5P30532 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHRNA5P30532 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHRNA5P30532 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHRNA5P30532 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CHRNA5P30532 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHRNA5P30532 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHRNA5P30532 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHRNA5P30532 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHRNA5P30532 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHRNA5P30532 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CHRNA5P30532 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHRNA5P30532 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHRNA5P30532 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHRNA5P30532 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHRNA5P30532 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHRNA5P30532 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHRNA5P30532 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHRNA5P30532 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHRNA5P30532 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHRNA5P30532 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHRNA5P30532 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHRNA5P30532 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHRNA5P30532 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CHRNA5P30532 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHRNA5P30532 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms