Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HTR1EP28566 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HTR1EP28566 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms