Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHCGRP22888 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHCGRP22888 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LHCGRP22888 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHCGRP22888 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHCGRP22888 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHCGRP22888 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHCGRP22888 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHCGRP22888 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHCGRP22888 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LHCGRP22888 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LHCGRP22888 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LHCGRP22888 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LHCGRP22888 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHCGRP22888 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms